В НГТУ относительно близким к мехмату можно разве что ФПМИ назвать. На остальных факультетах математика совсем в зачаточном уровне даётся.
А вообще всё‑таки нужно определиться, чего хочется: диплом или знания. Если знания, то теоретические или практические? Если ближе теория, то выбрать НГУ. Иначе — НГТУ.
Если нужен чисто диплом, который даст больше заработных перспектив... Выбирай где проще. НИИЖТ тот же. У них своя каста, перспективно.