2) тут как раз всё логически в порядке. когда терминатор в терминаторе 1 разгромил участок, там остались запись и протокол допроса Кайла Риза. он не фигурирует как отец Джона Коннора, но он боец сопротивления людей машинам, он отправлен Коннором в прошлое. эти записи Скайнет мог получить и мог найти их путём перебора архивов по Коннору.
3) все сцены Хелены Бонем Картер по отснятому хронометражу занимали всего 25 минут, поэтому говорить о кастрации фильма тут неуместно.
4) прямо противоречит всем остальным фильмам вселенной, точней выдуман попендикулярно ей.